内设机构
(一)办公室(加挂“信访室”牌子)
综合协调局机关和直属单位行政事务，制定局机关内部管理制度；负责文电、会务、机要、档案等机关日常工作；负责重要文件和报告的起草工作；承担宣传、统计、保密、接待、信访、安全、督办、应急管理、提案议案办理、信息网络化建设、信息反馈、政务公开、计划生育、后勤服务等工作。受理、交办、转送信访人提出的信访事项；承办上级交通运输部门和县委、县政府交办的信访事项；协调处理重要信访事项，督促检查信访事项办理情况。
(二)政工人事股(加挂“离退休人员管理服务股”牌子)
负责局机关和直属单位的党组织建设、干部人事、劳动工资、机构编制和教育培训管理工作；按照干部管理权限，承办局机关和直属单位领导干部和工作人员的选拔、考核、培训、任免、奖惩、调配及出国(境)人员政审等事项；负责局机关和指导直属单位离退休人员管理、服务工作；负责交通运输行业精神文明建设和职工队伍建设的日常工作；负责专业技术人员管理、职称评定、技工职业技能鉴定和等级考核、人才交流、智力引进工作。
(三)财务会计股（加挂“审计股”牌子）
负责指导、监督全县交通运输行业的财务会计工作，组织制订相关规章制度并监督执行；负责全系统交通运输各项资金的管理、拨付和监督；负责交通国有资产管理和交通投、融资管理；负责局机关财务管理和直属事业单位财政预算、审查、报批；指导交通行业的贷款，税收与利用外资方面的财务工作；归口管理行政事业收费。
负责交通系统内部审计工作，检查本系统有关财经纪律、政策法规的执行情况及年度预算执行情况；负责二级机构经济效益和任期经济责任审计。
(四)规划统计股
负责组织编制全县交通运输行业总体发展战略和中、长期发展规划；负责组织编制道路、水路、铁路、交通基础设施、城市公共交通、区域综合运输、交通科技发展等专项规划并监督实施；负责编制全县交通基础设施建设年度计划；负责交通运输行业综合统计工作；负责交通建设项目前期工作；负责交通运输、招商引资项目管理工作；负责组织、协调、监督交通运输行业环境保护工作。
(五)基本建设股(加挂“招投标管理办公室”牌子)
负责组织实施交通运输建设管理的政策、规章和技术标准；负责交通运输建设市场的培育和管理；负责全县交通运输建设项目行业管理；负责交通建设项目的招投标、工程造价、工程质量的管理和监督；负责交通重点建设项目的监督实施。
(六)政策法规股
负责组织起草综合性地方交通运输规范性文件，并对局机关规范性文件进行审核；负责局机关重大行政决策的合法性审查；负责全县交通运输行业的政策研究和法制建设；负责交通运输法律法规的宣传、行政复议、执法监督检查和执法人员培训工作，负责交通运输行政执法，指导交通运输行业执法队伍建设；承担社会治安综合治理和维稳工作；负责监督和指导全县治理车辆超限超载工作；负责全县道路、水路治理“三乱”工作；负责行业普法工作；承办局机关行政复议、听证、应诉等法律事务。
(七) 行政审批办公室
根据授权，统一受理、承办和组织办理本系统所有行政许可、行政服务及行政事业性收费等事项。
(八)运输管理股（加挂“县节假日运输领导小组办公室”、“交通战备办公室”牌子）
负责全县道路、水路、管道、地方性铁路运输的行业管理工作；负责交通运输业户的资质审查工作；负责城乡公共交通发展规划工作；负责城市公共客运行业政府补贴、政策的落实和定额工作；负责管理全县道路、水路客货运输从业人员的教育培训工作；负责交通行业环境保护和节能减排工作；负责交通运输行业的价格和收费标准的拟定；负责春运、军运和防汛、抢险、救灾等运输组织协调工作；负责铁路、道路、水路、航空、邮政等各种运输的综合协调和衔接。
负责规划全县国防交通网络布局；拟订全县国防交通保障计划、工作规定；负责对交通基础建设提出贯彻国防要求的建议；负责组织国防交通保障队伍；负责全县国防运力动员和运力征用，管理全县国防交通工程；组织全县国防交通科学技术研究及其成果的推广、应用。
（九）科技信息股（加挂“物流管理股”牌子）
负责拟定交通运输业物流发展的规划和措施；组织实施物流业发展规划；负责全县物流业的行业管理；指导、监督和服务全县物流园区的发展；协调重点物流项目的建设，组织实施物流行业招商引资；负责物流统计和信息引导工作。负责项目技术改造、交通科技工作；负责项目技术改造、交通科技工作、“智慧交通”信息化建设工作，组织开展技术研究和经验交流。
(十)农村公路管理股
负责宣传贯彻落实相关法律法规，承担综合全县农村公路建设、养护和管理的综合信息工作，研究农村公路建设、养护、管理中有关重大问题并提出意见建议；承担组织开展有关技术研究和经验交流；参与编制全县农村公路发展规划、农村公路建养年度计划并监督实施；承担全县农村公路调查、统计、设计评审和公路路况技术标准评定工作，参与农村公路建设、养护和管理的绩效考核，指导农村公路行业管理。
机关党组织和纪检监察机构按章程和规定设置。